Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL23P55773 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL23P55773 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL23P55773 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL23P55773 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL23P55773 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL23P55773 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL23P55773 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL23P55773 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL23P55773 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL23P55773 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL23P55773 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL23P55773 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL23P55773 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL23P55773 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL23P55773 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL23P55773 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL23P55773 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL23P55773 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL23P55773 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL23P55773 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL23P55773 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL23P55773 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL23P55773 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL23P55773 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL23P55773 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL23P55773 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL23P55773 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL23P55773 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL23P55773 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL23P55773 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL23P55773 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL23P55773 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL23P55773 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL23P55773 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL23P55773 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL23P55773 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL23P55773 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL23P55773 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL23P55773 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL23P55773 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL23P55773 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL23P55773 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL23P55773 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL23P55773 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL23P55773 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL23P55773 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL23P55773 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL23P55773 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL23P55773 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL23P55773 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL23P55773 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL23P55773 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL23P55773 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL23P55773 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL23P55773 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL23P55773 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL23P55773 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL23P55773 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCL23P55773 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL23P55773 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL23P55773 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL23P55773 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL23P55773 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL23P55773 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL23P55773 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL23P55773 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms