Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH4P55283 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH4P55283 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH4P55283 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH4P55283 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH4P55283 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH4P55283 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH4P55283 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH4P55283 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH4P55283 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH4P55283 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH4P55283 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH4P55283 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH4P55283 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH4P55283 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH4P55283 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms