Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFAP3P55082 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MFAP3P55082 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms