Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN5P54829 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms