Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP12AP54707 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms