Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms