Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms