Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3M2P53677 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms