Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-5P52952 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms