Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms