Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KA3P51812 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KA3P51812 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms