Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR3P51677 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR3P51677 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR3P51677 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR3P51677 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR3P51677 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR3P51677 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR3P51677 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR3P51677 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR3P51677 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR3P51677 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR3P51677 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR3P51677 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR3P51677 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR3P51677 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms