Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SMARCA4P51532 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC39.51■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA4P51532 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms