Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms