Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK2P49760 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK2P49760 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK2P49760 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK2P49760 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK2P49760 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK2P49760 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK2P49760 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK2P49760 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK2P49760 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK2P49760 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK2P49760 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms