Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLK1P49759 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLK1P49759 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLK1P49759 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLK1P49759 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLK1P49759 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLK1P49759 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLK1P49759 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLK1P49759 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLK1P49759 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLK1P49759 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLK1P49759 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLK1P49759 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLK1P49759 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms