Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP4P49662 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP4P49662 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP4P49662 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP4P49662 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP4P49662 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP4P49662 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP4P49662 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP4P49662 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP4P49662 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP4P49662 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP4P49662 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP4P49662 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP4P49662 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP4P49662 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP4P49662 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP4P49662 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP4P49662 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP4P49662 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP4P49662 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP4P49662 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms