Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTAP49354 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTAP49354 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTAP49354 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTAP49354 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTAP49354 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTAP49354 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTAP49354 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTAP49354 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTAP49354 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTAP49354 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTAP49354 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTAP49354 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTAP49354 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTAP49354 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTAP49354 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTAP49354 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTAP49354 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTAP49354 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTAP49354 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms