Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK8P49336 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK8P49336 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK8P49336 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK8P49336 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK8P49336 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK8P49336 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK8P49336 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK8P49336 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK8P49336 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK8P49336 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK8P49336 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK8P49336 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK8P49336 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK8P49336 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK8P49336 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK8P49336 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK8P49336 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK8P49336 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK8P49336 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK8P49336 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK8P49336 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK8P49336 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK8P49336 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK8P49336 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK8P49336 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK8P49336 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK8P49336 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK8P49336 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK8P49336 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK8P49336 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK8P49336 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK8P49336 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK8P49336 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK8P49336 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK8P49336 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK8P49336 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK8P49336 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK8P49336 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK8P49336 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK8P49336 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK8P49336 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK8P49336 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK8P49336 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK8P49336 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK8P49336 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms