Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRPC1P48995 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRPC1P48995 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms