Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NESP48681 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NESP48681 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NESP48681 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
NESP48681 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NESP48681 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NESP48681 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NESP48681 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
NESP48681 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NESP48681 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NESP48681 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NESP48681 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NESP48681 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NESP48681 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NESP48681 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NESP48681 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NESP48681 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NESP48681 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NESP48681 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NESP48681 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NESP48681 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NESP48681 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NESP48681 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NESP48681 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NESP48681 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NESP48681 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NESP48681 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NESP48681 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NESP48681 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NESP48681 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NESP48681 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NESP48681 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC38.2■■■■□ 3.7
NESP48681 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.7
NESP48681 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.7
NESP48681 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NESP48681 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NESP48681 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NESP48681 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NESP48681 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NESP48681 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NESP48681 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NESP48681 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NESP48681 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NESP48681 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NESP48681 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
NESP48681 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NESP48681 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
NESP48681 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
NESP48681 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
NESP48681 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NESP48681 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NESP48681 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NESP48681 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NESP48681 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NESP48681 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NESP48681 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NESP48681 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
NESP48681 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NESP48681 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NESP48681 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NESP48681 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NESP48681 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NESP48681 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NESP48681 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NESP48681 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NESP48681 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NESP48681 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NESP48681 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NESP48681 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
NESP48681 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NESP48681 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
NESP48681 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NESP48681 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NESP48681 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NESP48681 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NESP48681 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NESP48681 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NESP48681 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
NESP48681 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NESP48681 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NESP48681 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
NESP48681 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms