Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10P48553 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms