Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms