Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGRP47804 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGRP47804 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGRP47804 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGRP47804 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGRP47804 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGRP47804 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGRP47804 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGRP47804 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGRP47804 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGRP47804 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGRP47804 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGRP47804 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGRP47804 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGRP47804 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGRP47804 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGRP47804 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGRP47804 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGRP47804 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGRP47804 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGRP47804 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGRP47804 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGRP47804 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGRP47804 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGRP47804 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGRP47804 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGRP47804 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGRP47804 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGRP47804 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGRP47804 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGRP47804 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGRP47804 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGRP47804 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGRP47804 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGRP47804 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms