Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms