Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRXP46100 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRXP46100 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRXP46100 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRXP46100 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRXP46100 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRXP46100 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRXP46100 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRXP46100 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRXP46100 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRXP46100 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRXP46100 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRXP46100 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRXP46100 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRXP46100 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRXP46100 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRXP46100 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRXP46100 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRXP46100 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRXP46100 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRXP46100 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms