Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms