Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSOP43234 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSOP43234 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSOP43234 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSOP43234 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSOP43234 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSOP43234 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSOP43234 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSOP43234 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSOP43234 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSOP43234 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSOP43234 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms