Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms