Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSG1P42857 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSG1P42857 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSG1P42857 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSG1P42857 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSG1P42857 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NSG1P42857 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NSG1P42857 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSG1P42857 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSG1P42857 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSG1P42857 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSG1P42857 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSG1P42857 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSG1P42857 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSG1P42857 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms