Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELK3P41970 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELK3P41970 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ELK3P41970 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ELK3P41970 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELK3P41970 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELK3P41970 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELK3P41970 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELK3P41970 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms