Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPHP41219 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPHP41219 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPHP41219 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPHP41219 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPHP41219 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPHP41219 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPHP41219 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms