Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP8P40818 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP8P40818 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP8P40818 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP8P40818 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP8P40818 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP8P40818 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP8P40818 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP8P40818 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP8P40818 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP8P40818 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP8P40818 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP8P40818 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP8P40818 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP8P40818 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP8P40818 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP8P40818 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP8P40818 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP8P40818 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP8P40818 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP8P40818 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP8P40818 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP8P40818 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP8P40818 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP8P40818 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP8P40818 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms