Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	YJL147C	YJL147C	1149 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	JLP1	YLL057C	1239 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	FMP41	YNL168C	780 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	PPG1	YNR032W	1107 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	WRS1	YOL097C	1299 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	ICY2	YPL250C	411 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YPL278C	YPL278C	303 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	DAL81	YIR023W	2913 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	UBA2	YDR390C	1911 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	RCM1	YNL022C	1473 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	PGD1	YGL025C	1194 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	COS12	YGL263W	1143 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	NAT2	YGR147C	867 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	TDA10	YGR205W	873 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	IME1	YJR094C	1083 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	PRX1	YBL064C	786 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	NRM1	YNR009W	750 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	IZH2	YOL002C	954 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	CKA2	YOR061W	1020 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	SYC1	YOR179C	567 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	SSH4	YKL124W	1740 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	IMA1	YGR287C	1770 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	MKS1	YNL076W	1755 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	MDL1	YLR188W	2088 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YDL016C	YDL016C	303 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	LSM4	YER112W	564 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	ERV29	YGR284C	933 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	PRS3	YHL011C	963 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YHR173C	YHR173C	339 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	LNP1	YHR192W	837 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	CAP2	YIL034C	864 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	TEF4	YKL081W	1239 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	RLP24	YLR009W	600 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YLR217W	YLR217W	324 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	IMP2	YMR035W	534 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	DLT1	YMR126C	1029 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	DGA1	YOR245C	1257 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	OXR1	YPL196W	822 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	PMS1	YNL082W	2622 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	ERG9	YHR190W	1335 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	DPH6	YLR143W	2058 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	RTK1	YDL025C	1863 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	TGL2	YDR058C	981 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	OCA6	YDR067C	675 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	GRX3	YDR098C	858 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YGL242C	YGL242C	546 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	PTI1	YGR156W	1278 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	LIN1	YHR156C	1023 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	TOM7	YNL070W	183 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	ARF3	YOR094W	552 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	HNT3	YOR258W	654 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	POP7	YBR167C	423 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	AKL1	YBR059C	3327 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	KRE6	YPR159W	2163 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	TUL1	YKL034W	2277 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	NGL2	YMR285C	1548 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	CDC4	YFL009W	2340 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	MNT2	YGL257C	1677 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	NOC4	YPR144C	1659 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	MSC2	YDR205W	2175 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YCL076W	YCL076W	744 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YCR001W	YCR001W	315 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	NSE4	YDL105W	1209 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	GIM4	YEL003W	336 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YGL109W	YGL109W	324 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	LYS5	YGL154C	819 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	THP2	YHR167W	786 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YIL165C	YIL165C	360 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	SYS1	YJL004C	612 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	GCD14	YJL125C	1152 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	STE18	YJR086W	333 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YMR144W	YMR144W	1029 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	NIS1	YNL078W	1224 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	TUM1	YOR251C	915 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YDR210W-A	YDR210W-A	1317 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	TDA3	YHR009C	1572 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	GZF3	YJL110C	1656 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YTA12	YMR089C	2478 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YCL068C	YCL068C	783 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YDR248C	YDR248C	582 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	PDR15	YDR406W	4590 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	GRX4	YER174C	735 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YFR035C	YFR035C	345 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	MST27	YGL051W	705 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	BET4	YJL031C	984 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	IDS2	YJL146W	1410 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	MST28	YAR033W	705 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	RPN13	YLR421C	471 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YLR444C	YLR444C	303 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	PPT2	YPL148C	522 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	USV1	YPL230W	1176 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	YPR078C	YPR078C	1119 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YBR053C	P38235	AXL2	YIL140W	2472 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	ZPR1	YGR211W	1461 nt		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 103.5 ms