Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVRL1P37023 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms