Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms