Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COPB2P35606 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPB2P35606 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPB2P35606 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB2P35606 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB2P35606 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB2P35606 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB2P35606 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB2P35606 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB2P35606 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB2P35606 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB2P35606 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPB2P35606 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPB2P35606 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPB2P35606 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPB2P35606 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB2P35606 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB2P35606 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COPB2P35606 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB2P35606 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB2P35606 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB2P35606 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB2P35606 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB2P35606 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB2P35606 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB2P35606 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPB2P35606 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPB2P35606 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPB2P35606 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPB2P35606 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPB2P35606 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB2P35606 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB2P35606 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB2P35606 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms