Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms