Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIITAP33076 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIITAP33076 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIITAP33076 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIITAP33076 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIITAP33076 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIITAP33076 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIITAP33076 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIITAP33076 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIITAP33076 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIITAP33076 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIITAP33076 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIITAP33076 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CIITAP33076 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CIITAP33076 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CIITAP33076 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIITAP33076 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIITAP33076 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIITAP33076 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIITAP33076 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIITAP33076 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CIITAP33076 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIITAP33076 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIITAP33076 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIITAP33076 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIITAP33076 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIITAP33076 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIITAP33076 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIITAP33076 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIITAP33076 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms