Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A1P32418 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms