Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTGFP29279 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTGFP29279 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTGFP29279 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTGFP29279 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTGFP29279 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTGFP29279 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTGFP29279 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTGFP29279 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTGFP29279 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTGFP29279 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTGFP29279 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTGFP29279 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTGFP29279 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTGFP29279 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTGFP29279 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTGFP29279 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTGFP29279 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTGFP29279 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTGFP29279 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTGFP29279 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTGFP29279 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTGFP29279 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTGFP29279 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTGFP29279 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTGFP29279 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTGFP29279 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTGFP29279 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTGFP29279 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTGFP29279 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTGFP29279 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTGFP29279 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTGFP29279 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTGFP29279 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTGFP29279 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTGFP29279 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTGFP29279 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTGFP29279 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTGFP29279 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTGFP29279 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTGFP29279 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTGFP29279 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTGFP29279 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTGFP29279 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTGFP29279 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTGFP29279 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTGFP29279 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTGFP29279 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTGFP29279 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTGFP29279 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTGFP29279 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms