Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DNMT1P26358 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
DNMT1P26358 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms