Protein–RNA interactions for Protein: P23560

BDNF, Brain-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNFP23560 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BDNFP23560 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BDNFP23560 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BDNFP23560 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BDNFP23560 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BDNFP23560 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BDNFP23560 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BDNFP23560 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDNFP23560 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDNFP23560 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDNFP23560 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDNFP23560 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDNFP23560 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDNFP23560 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDNFP23560 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDNFP23560 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDNFP23560 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms