Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP100P23497 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP100P23497 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP100P23497 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP100P23497 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP100P23497 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP100P23497 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SP100P23497 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SP100P23497 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SP100P23497 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP100P23497 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP100P23497 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP100P23497 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP100P23497 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP100P23497 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP100P23497 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP100P23497 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP100P23497 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP100P23497 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP100P23497 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP100P23497 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP100P23497 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SP100P23497 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP100P23497 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP100P23497 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP100P23497 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP100P23497 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP100P23497 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms