Protein–RNA interactions for Protein: P22897

MRC1, Macrophage mannose receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRC1P22897 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MRC1P22897 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRC1P22897 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRC1P22897 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRC1P22897 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRC1P22897 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRC1P22897 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRC1P22897 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRC1P22897 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRC1P22897 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRC1P22897 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRC1P22897 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRC1P22897 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRC1P22897 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRC1P22897 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRC1P22897 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MRC1P22897 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRC1P22897 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MRC1P22897 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MRC1P22897 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRC1P22897 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRC1P22897 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MRC1P22897 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MRC1P22897 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRC1P22897 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRC1P22897 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRC1P22897 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRC1P22897 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRC1P22897 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRC1P22897 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRC1P22897 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRC1P22897 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRC1P22897 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRC1P22897 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MRC1P22897 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MRC1P22897 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms