Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGFR4P22455 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGFR4P22455 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms