Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD247P20963 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD247P20963 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD247P20963 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CD247P20963 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD247P20963 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD247P20963 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD247P20963 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD247P20963 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD247P20963 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD247P20963 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD247P20963 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD247P20963 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms