Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms