Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMY2BP19961 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms