Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFE3P19532 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFE3P19532 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFE3P19532 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFE3P19532 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFE3P19532 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TFE3P19532 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFE3P19532 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms